bioconductor

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Problema de instalación del paquete GenomicFeatures

Lamento haber vuelto tan pronto con una simple pregunta de instalación, pero mi incapacidad para resolverlo por mi cuenta está afectando seriamente mi productividad. De todos modos, traté de instalar

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Estoy utilizando el paquete Bioconductor CMA para realizar validación cruzada interna de Monte Carlo (MCCV) en clasificadores SVM en un microarray conjunto de datos. CMA usa internamente el paquete e1

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rpy2: Convertir un data.frame en una matriz numpy

Tengo un data.frame en R. Contiene una gran cantidad de datos: niveles de expresión génica de muchas (125) matrices. Me gustaría que los datos en Python, debido principalmente a mi incompetencia en R

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Tengo un objeto ExpressionSet con 100 muestras: > length(sampleNames(eset1)) 100 También tengo un vector de los nombres de 75 muestras (no de los datos en sí): > length(vecOf75) 75 ¿Cómo puedo s

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R + Bioconductor: combina probesets en un ExpressionSet

En primer lugar, este puede ser el foro incorrecto para esta pregunta, ya que es bastante maldito R + Bioconductor específico. Aquí es lo que tengo: library('GEOquery') GDS = getGEO('GDS785') cd4T =