shapefile de salida para la red igraph en I

Question

Hola Tengo una red en I usando la biblioteca igraph

Vertices: 616 
Edges: 6270 
Directed: TRUE 
No graph attributes. 
Vertex attributes: name, Lat, Lon. 
Edge attributes: V3. 

¿Cómo puedo generar dos archivos de forma de los vértices y los bordes usando la información Lat, Lon en el vértice ?

Answer 1

Puede hacerlo utilizando los paquetes sp y maptools. Hay funciones prácticas writePointsShape() y writeLinesShape() en maptools que escribirán en el formato de archivo de forma de ESRI.

Antes de hacer esto, es necesario extraer la información lat/lon de los vértices del gráfico y ponerla en un objeto SpatialPoints para los vértices, y un objeto SpatialLinesDataFrame para los bordes.

Este código produce un muy simple igraph objeto para el siguiente ejemplo:

library(igraph) 

## Produce a ring graph with 4 vertices 
x <- graph.ring(4) 

## Add lat/lon information to vertices 
V(x)$lat <- c(50, 50, 51, 51) 
V(x)$lon <- c(40, 41, 41, 40) 

Ahora, crear el objeto SpatialPoints para los vértices

library(sp) 
library(maptools) 

## Create SpatialPoints object containing coordinates 
xV <- SpatialPoints(cbind(V(x)$lon, V(x)$lat)) 

## Write vertices to a shapefile 
writePointsShape(xV, fn="vertices") 

último, crear el objeto SpatialLinesDataFrame para los bordes. Esto es un poco desordenado, pero todavía tengo que encontrar una forma rápida de producir un objeto SpatialLines con coordenadas dadas.

## Create SpatialLinesDataFrame object describing edges 
edges <- get.edgelist(x)+1 
edges <- cbind(edgeNum=1:nrow(edges), v1=edges[,1], v2=edges[,2]) 
xE <- apply(edges, 1, function(i) Lines(Line(cbind(c(V(x)$lon[i["v1"]], V(x)$lon[i["v2"]]), c(V(x)$lat[i["v1"]], V(x)$lat[i["v2"]]))), ID=as.character(i["edgeNum"]))) 
xE <- SpatialLinesDataFrame(SpatialLines(xE), data=data.frame(edgeNum=1:nrow(edges))) 

## Write edges to a shapefile 
writeLinesShape(xE, fn="edges")