I tiene una el siguiente diagrama creado en igraph
Controlling que los bordes son visibles en un diagrama de red en igraph en r
set.seed(1410)
df<-data.frame(
"site.x"=c(rep("a",4),rep("b",4),rep("c",4),rep("d",4)),
"site.y"=c(rep(c("e","f","g","h"),4)),
"bond.strength"=sample(1:100,16, replace=TRUE))
library(igraph)
df<-graph.data.frame(df)
V(df)$names <- c("a","b","c","d","e","f","g","h")
layOUT<-data.frame(x=c(rep(1,4),rep(2,4)),y=c(4:1,4:1))
E(df)[ bond.strength < 101 ]$color <- "red"
E(df)[ bond.strength < 67 ]$color <- "yellow"
E(df)[ bond.strength < 34 ]$color <- "green"
V(df)$color <- "white"
l<-as.matrix(layOUT)
plot(df,layout=l,vertex.size=10,vertex.label=V(df)$names,
edge.arrow.size=0.01,vertex.label.color = "black")
Quiero mostrar todos los vértices/nodos, pero sólo bordes donde bond.strength> 34 (es decir, solo los bordes rojo y amarillo). Puedo controlar esto mediante el establecimiento bond.strength < 34 a blanco, pero no es bastante cuando se hace en mis datos reales establecidos como los bordes blancos "cortar a través de" los otros bordes, es decir
¿Hay otra manera de simplemente controlar qué bordes son visibles mientras se muestran todos los vértices? Gracias
Eso funcionó muy bien. ¡Gracias! – Elizabeth
Esto no es perfecto, porque algunos dispositivos no son compatibles con la transparencia. Una mejor solución es establecer el tipo de línea a '0', lo que significa que no hay línea en absoluto:' E (df) [bond.strength <34] $ lty <- 0'. –
muy bueno! la transparencia era el truco que necesito para hacer que los nodos desaparezcan silenciosamente. size = 0, shape = "none" y muchas otras configuraciones simplemente no funcionaron. Gracias – Raffael