Prueba exacta de Fisher eficiente en Java

Question

Necesito una biblioteca/función/método para realizar una prueba exacta de Fisher en Java, y proporcionar las probabilidades derecha, izquierda y de dos colas. Simple Googling muestra una solución dentro de los paquetes de Tassel, pero el método interno simplemente aplica los pasos de prueba sin optimización, y por lo tanto es extremadamente lento. Además, usa tipos int en todas partes y no es realmente eficiente para grandes tablas de contingencia.

Si conoce alguna solución ya escrita, ayudarme :-)

Answer 1

ver si esto ayuda: http://www.users.zetnet.co.uk/hopwood/tools/StatTests.java

El formula es bastante simple. Aquí hay una implementación muy simple (dos colas): http://javanus.com/blogs/?p=51 (vea el comentario de Discretoboy para una implementación mucho más clara)

También puede consultar el test implementation en Java Statistical Classes.

Answer 2

usar http://wordhoard.northwestern.edu/userman/javadoc/edu/northwestern/at/utils/math/statistics/FishersExactTest.html

A (muy) pequeña prueba demostró que era similar en velocidad a las clases de Java estadísticos (JSC) de la prueba anteriormente mencionada pero tenía la ventaja adicional de no darme una excepción ilegal argumento cuando mi tabla incluía cero, que creo que es un caso legítimo.