GraphViz - ¿Cómo conectar subgrafos?

Question

En el idioma DOT para GraphViz, intento representar un diagrama de dependencia. Necesito poder tener nodos dentro de un contenedor y poder hacer que los nodos y/o contenedores dependan de otros nodos y/o contenedores.

Estoy usando subgraph para representar mis contenedores. La vinculación de nodos funciona bien, pero no sé cómo conectar subgrafos.

Dado el siguiente programa, tengo que ser capaz de conectarse cluster_1 y cluster_2 con una flecha, pero nada de lo que he intentado crea nuevos nodos en lugar de conectar los racimos:

digraph G { 

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana"]; 
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"]; 

    subgraph cluster_0 { 
     node [style=filled]; 
     "Item 1" "Item 2"; 
     label = "Container A"; 
     color=blue; 
    } 

    subgraph cluster_1 { 
     node [style=filled]; 
     "Item 3" "Item 4"; 
     label = "Container B"; 
     color=blue; 
    } 

    subgraph cluster_2 { 
     node [style=filled]; 
     "Item 5" "Item 6"; 
     label = "Container C"; 
     color=blue; 
    } 

    // Renders fine 
    "Item 1" -> "Item 2"; 
    "Item 2" -> "Item 3"; 

    // Both of these create new nodes 
    cluster_1 -> cluster_2; 
    "Container A" -> "Container C"; 
} 

Answer 1

El manual de usuario de DOT proporciona el siguiente ejemplo de un gráfico con conglomerados con bordes entre los clústeres

digraph G { 
    compound=true; 
    subgraph cluster0 { 
    a -> b; 
    a -> c; 
    b -> d; 
    c -> d; 
    } 
    subgraph cluster1 { 
    e -> g; 
    e -> f; 
    } 
    b -> f [lhead=cluster1]; 
    d -> e; 
    c -> g [ltail=cluster0,lhead=cluster1]; 
    c -> e [ltail=cluster0]; 
    d -> h; 
} 

y bordes entre nodos y clústeres.

Answer 2

Para facilidad de referencia la solución descrita en la respuesta de HighPerformanceMark, aplicado directamente a la pregunta original, se ve así:

digraph G { 

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana" compound=true]; 
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"]; 

    subgraph cluster_0 { 
     node [style=filled]; 
     "Item 1" "Item 2"; 
     label = "Container A"; 
     color=blue; 
    } 

    subgraph cluster_1 { 
     node [style=filled]; 
     "Item 3" "Item 4"; 
     label = "Container B"; 
     color=blue; 
    } 

    subgraph cluster_2 { 
     node [style=filled]; 
     "Item 5" "Item 6"; 
     label = "Container C"; 
     color=blue; 
    } 

    // Edges between nodes render fine 
    "Item 1" -> "Item 2"; 
    "Item 2" -> "Item 3"; 

    // Edges that directly connect one cluster to another 
    "Item 1" -> "Item 3" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_1]; 
    "Item 1" -> "Item 5" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_2]; 
} 

El 'compuesto = true' en la declaración 'gráfico' Es vital. Que produce salidas:

Nota de que he cambiado los bordes para hacer referencia a los nodos dentro de la agrupación, agregó el ltail y atributos lhead a cada borde, especificando el nombre del clúster, y añade el compuesto de nivel gráfico atributo' = verdadero '.

En cuanto a la preocupación de que uno quiera conectar un clúster sin nodos dentro de él, mi solución ha sido siempre agregar un nodo a cada clúster, representado con style = plaintext. Utilice este nodo para etiquetar el clúster (en lugar del atributo "etiqueta" integrado del clúster, que se debe establecer en la cadena vacía (en Python, label='""'). Esto significa que ya no añado bordes que conectan clusters directamente, sino funciona en mi situación particular.

Answer 3

Asegúrese de que está utilizando fdp diseño para el archivo. no creo neato admite clústeres.