¿Hay una manera fácil de activar todos los elementos GUI en R y ejecutarlo únicamente desde la línea de comandos en OSX?Deshabilitar GUI, dispositivos gráficos en R
Estoy tratando de replicar el comportamiento de un terminal de Linux remoto en mi máquina OSX. Así, plot() debería simplemente guardar un archivo y cosas como CRAN mirror selection deberían ser texto, no una interfaz Tk. Tengo problemas para encontrar dónde establecer este comportamiento.
No soy dueño de una caja de OS X, pero ¿trató de desarmar el X11 variable de entorno DISPLAY:
DISPLAY = "" R --vanilla
Cuando hago eso en Linux y consulta R para capabilties(), x11 aparece como FALSE según lo deseado.
Para los gráficos, puede dirigir la salida a un archivo utilizando el comando pdf() (o png(), jpeg() ...).
No ejecuto OSX pero podría intentar ejecutar R desde la aplicación Terminal, en lugar de ejecutar Mac OSX, y ver si eso funciona como lo necesita.
Al escribir Matti, puede enviar los resultados a los archivos con los siguientes comandos; pero no sé si esa es realmente la esencia de tu pregunta.
png("pngfile.png")
plot(foo)
title(main="bar")
dev.off()
Así que en lugar del objeto gráfico de cuarzo, su salida va al archivo.
De forma similar, puede generar lo que normalmente aparecería en el terminal de un archivo.
sink("foo.file")
Incluso la línea de comando R abre una ventana de cuarzo por defecto si existe la capacidad. La única forma que he encontrado para desactivarlo es compilar R sin soporte de agua, pero eso es menos que ideal. – Tristan
Usar el comando 'png() 'es realmente un mal ejemplo, porque png en realidad requiere una conexión X11 para hacer la representación. Reemplácela por algo como 'pdf() ' – parasietje
La última R se puede compilar para tener soporte png() sin requerir X11 (mediante lienzo). En caso de que alguien lea este comentario. – dieresys
Tenía esta pregunta exacta y quería una manera de hacerlo sin cambiar mi código existente. Normalmente corro con soporte de gráficos, pero a veces ejecuto un script en el servidor para un conjunto de datos más grande y luego solo quiero que los gráficos se envíen a algún lugar de forma automática.
En la respuesta de Dirk, Ian Fellows ofrece la solución más simple. En la línea de comandos de tipo R:
options(device=pdf)
Y entonces ningún parcelas serán escritos a la corriente directamente a un archivo Rplots.pdf.
Si desea que los archivos no se pueden trazar en todo, entonces utilizar
options(device=NULL)
Eso hace x11 efectivamente desactivar, pero deja Acqua y tcltk cierto. plot() todavía abre una ventana de cuarzo. – Tristan
options (device = pdf) –