matplotlib.pyplot/pylab no actualizando figure while isinteractive(), usando ipython -pylab

Question

Hay muchas preguntas sobre matplotlib, pylab, pyplot, ipython, así que lamento si está cansado de ver esto. Trataré de ser lo más específico posible, porque he estado revisando las preguntas de las personas y mirando la documentación de pyplot y pylab, y todavía no estoy seguro de lo que estoy haciendo mal. Activado con el código:

Objetivo: trazar una figura cada 0,5 segundos y actualizar la figura tan pronto como se llame al comando de trazado.

Mi intento de codificar esta siguiente (que se ejecuta en -pylab ipython):

 

import time 
ion() 
x=linspace(-1,1,51) 
plot(sin(x)) 
for i in range(10): 
    plot([sin(i+j) for j in x]) 
    #see ** 
    print i 
    time.sleep(1) 
print 'Done' 
 

correctamente parcelas cada línea, pero no hasta que haya salido el bucle. He intentado forzar un rediseño poniendo draw() donde está **, pero eso tampoco parece funcionar. Idealmente, me gustaría que simplemente agregue cada línea, en lugar de hacer un redibujado completo. Sin embargo, si se necesita volver a dibujar, está bien.

intentos adicionales de problemas:
justo después ion(), añadiendo hold(True) trataron en vano.
por diversión trataron show() para **
La respuesta más cercana que he encontrado lo que estoy tratando de hacer estaba en plotting lines without blocking execution, pero show() no está haciendo nada.

Pido disculpas si se trata de una solicitud directa, y estoy buscando algo tan obvio. Por lo que vale, esto surgió cuando estaba tratando de convertir el código matlab de la clase a una python para mi propio uso. El MATLAB originales (inicializaciones eliminados) que he estado tratando de convertir la siguiente manera:

for i=1:time 
    plot(u) 
    hold on 
    pause(.01) 
    for j=2:n-1 
     v(j)=u(j)-2*u(j-1) 
    end 
    v(1)= pi 
    u=v 
end 

Cualquier ayuda, incluso si es sólo "mirar hacia arriba this_method" sería excelente, así que al menos se puede reducir mis esfuerzos a averiguar cómo usar ese método. Si hay más información que sería útil, házmelo saber.

Answer 1

La segunda respuesta a la pregunta que ha vinculado proporciona la respuesta: llame al draw() después de cada plot() para que aparezca inmediatamente; por ejemplo:

import time 
ion() 
x = linspace(-1,1,51) 
plot(sin(x)) 
for i in range(10): 
    plot([sin(i+j) for j in x]) 
    # make it appear immediately 
    draw() 
    time.sleep(1) 

Si eso no funciona ... tratan de lo que hacen en esta página: http://www.scipy.org/Cookbook/Matplotlib/Animations

import time 

ion() 

tstart = time.time()    # for profiling 
x = arange(0,2*pi,0.01)   # x-array 
line, = plot(x,sin(x)) 
for i in arange(1,200): 
    line.set_ydata(sin(x+i/10.0)) # update the data 
    draw()       # redraw the canvas 

print 'FPS:' , 200/(time.time()-tstart) 

La página se menciona que la función line.set_ydata() es la parte clave.

Answer 2

Por favor, consulte el answer He publicado aquí una pregunta similar. Podría generar su animación sin problemas utilizando solo el backend GTKAgg GTKAgg. Para ello, es necesario añadir esta línea a su script (creo que antes de importar pylab):

matplotlib.use('GTkAgg') 

y también se instala PyGTK.

Answer 3

tenía exactamente el mismo problema con ipython ejecutándose en mi mac. (Enthought Distribución de python 2.7 32bit en Macbook pro corriendo leopardo de las nieves).

Recibí un consejo de un amigo en el trabajo.Ejecutar ipython de la terminal con los siguientes argumentos:

"ipython -wthread -pylab"

Esto funciona para mí. El código python anterior de "Daniel G" se ejecuta sin incidentes, mientras que anteriormente no actualizaba la trama.

De acuerdo con la documentación de ipython: "[-gthread, -qthread, -q4thread, -wthread, -pylab: ...] Proporcionan soporte de subprocesamiento para los kits de herramientas GTK, Qt (versiones 3 y 4) y WXPython, y para la biblioteca matplotlib ". No sé por qué eso es importante, pero funciona.

esperanza de que es útil, labjunky

Answer 4

from pylab import * 
import time 
ion() 
tstart = time.time()    # for profiling 
x = arange(0,2*pi,0.01)   # x-array 
line, = plot(x,sin(x)) 
for i in arange(1,200): 
    line.set_ydata(sin(x+i/10.0)) # update the data 
    draw()       # redraw the canvas 
    pause(0.01) 
print 'FPS:' , 200/(time.time()-tstart) 
ioff() 
show() 

#

Lo anterior funcionó muy bien para mí. Lo ejecuté en el editor de spyder en pythonxy2.7.3 bajo Win7 OS. Observe la instrucción pause() seguida de draw() seguida de ioff() y show().