Los errores Matplotlib provocan una pérdida de memoria. ¿Cómo puedo liberar esa memoria?

Question

Estoy ejecutando una aplicación django que incluye matplotlib y permite al usuario especificar los ejes del gráfico. Esto puede dar como resultado 'Error de desbordamiento: se excedió la complejidad de Agg'

Cuando eso sucede, hasta 100MB de RAM quedan atados. Normalmente, libero esa memoria utilizando fig.gcf(), plot.close() y gc.collect(), pero la memoria asociada con el error no parece estar asociada con el objeto de trazado.

¿Alguien sabe cómo puedo liberar esa memoria?

Gracias.

Aquí hay un código que me da el error de complejidad Agg.

import matplotlib 
matplotlib.use('Agg') 
import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np  
import gc 

a = np.arange(1000000) 
b = np.random.randn(1000000) 

fig = plt.figure(num=1, dpi=100, facecolor='w', edgecolor='w') 
fig.set_size_inches(10,7) 
ax = fig.add_subplot(111) 
ax.plot(a, b) 

fig.savefig('yourdesktop/random.png') # code gives me an error here 

fig.clf() # normally I use these lines to release the memory 
plt.close() 
del a, b 
gc.collect() 

Answer 1

Supongo que puede ejecutar el código que publicó al menos una vez. El problema solo se manifiesta después de ejecutar el código publicado muchas veces. ¿Correcto?

Si es así, lo siguiente evita el problema sin identificar realmente el origen del problema. Quizás eso sea algo malo, pero esto funciona en un momento: simplemente use multiprocessing para ejecutar el código de memoria intensiva en un proceso separado. No tiene que preocuparse por fig.clf() o plt.close() o del a,b o gc.collect(). Toda la memoria se libera cuando el proceso finaliza.

import matplotlib 
matplotlib.use('Agg') 
import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np  

import multiprocessing as mp 

def worker(): 
    N=1000000 
    a = np.arange(N) 
    b = np.random.randn(N) 

    fig = plt.figure(num=1, dpi=100, facecolor='w', edgecolor='w') 
    fig.set_size_inches(10,7) 
    ax = fig.add_subplot(111) 
    ax.plot(a, b) 

    fig.savefig('/tmp/random.png') # code gives me an error here 

if __name__=='__main__': 
    proc=mp.Process(target=worker) 
    proc.daemon=True 
    proc.start() 
    proc.join() 

Usted no tiene que proc.join() tampoco. El join bloqueará el proceso principal hasta que se complete el worker. Si omite el join, entonces el proceso principal simplemente continúa con el proceso worker trabajando en segundo plano.

Answer 2

me parece que aquí http://www.mail-archive.com/matplotlib-users@lists.sourceforge.net/msg11809.html , da una respuesta interesante que puede ayudar a

intente reemplazar:

import matplotlib.pyplot as plt 
fig = plt.figure() 

con

from matplotlib import figure 
fig = figure.Figure()