qsub

9El calor

4Respuesta

'Fin de archivo inesperado' y 'error al importar definición de función' error al ejecutar shellscript usando qsub

tengo el siguiente shellscript: #!/bin/sh cd /sw/local/bin/ export LD_LIBRARY_PATH=/sw/local/lib:/usr/local/Trolltech/Qt-4.7.2/lib:$LD_LIBRARY_PATH ./FeatureFinderRaw -in /homes/JG-C1-18.mzML -out

linux shell cluster-computing qsub 2012-05-08

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19El calor

2Respuesta

cómo especificar el archivo de registro de errores y el archivo de salida en qsub

Tengo un script qsub como #####----submit_job.sh---##### #!/bin/sh #$ -N job1 #$ -t 1-100 #$ -cwd SEEDFILE=/home/user1/data1 SEED=$(sed -n -e "$SGE_TASK_ID p" $SEEDFILE)

bash cluster-computing qsub sungridengine 2012-02-01

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5El calor

7Respuesta

SGE script: imprimir en el archivo durante la ejecución (no solo al final)?

Tengo un script SGE para ejecutar algún código python, enviado a la cola usando qsub. En el script de Python, tengo algunas declaraciones impresas (actualizándome sobre el progreso del programa). Cuan

python qsub sungridengine 2012-03-26

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5El calor

2Respuesta

¿puedo eliminar un script de shell después de que se haya enviado usando qsub sin afectar el trabajo?

Quiero enviar muchos trabajos usando qsub, los trabajos son todos muy similares. Tengo un script que tiene un bucle, y en cada instancia reescribe sobre un archivo tmpjob.sh y luego hace qsub tmpjob.s

linux shell cluster-computing qsub 2012-02-06

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6El calor

2Respuesta

¿Cómo maneja MATLAB el cambio de archivo mientras se está ejecutando el archivo?

Supongamos que comienza a ejecutar el script. ¿Qué sucede cuando cambias ese archivo cuando se está ejecutando? Parece que MATLAB toma una copia del archivo y luego comienza a ejecutarlo. Quiero asegu

matlab qsub 2012-02-11

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7El calor

1Respuesta

Excluir ciertos nodos al enviar trabajos con qsub/torque?

Al enviar trabajos por lotes con qsub, ¿hay alguna manera de excluir un determinado nodo (por nombre de host)? Algo así como # this is just a pseudo command: qsub myscript.sh --exclude computer01

torque qsub 2012-02-13

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23El calor

7Respuesta

Espere a que se complete el conjunto de trabajos de qsub

Tengo un script de proceso por lotes que comienza con un par de trabajos de qsub, y quiero interceptarlos cuando se hayan completado. No quiero usar la opción -sync, porque quiero que se ejecuten simu

qsub 2012-07-17

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9El calor

2Respuesta

Pase directamente parámetros a la secuencia de comandos pbs

¿Hay alguna forma de pasar parámetros directamente a una secuencia de comandos .pbs antes de enviar una tarea? Necesito recorrer una lista de archivos indicados por diferentes números y aplicar un scr

bash unix pbs qsub 2012-04-10

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6El calor

2Respuesta

Argumento que pasa en los scripts .sh

Tengo un script de shell foo.sh que es un trabajo qsub con contenido: #!/bin/bash -l #$ -S /bin/bash #$ -N $2 echo $1 me gustaría pasar dos argumentos. Si llamo a qsub foo.sh a b, el

shell parameter-passing options sh qsub 2012-01-08

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5El calor

2Respuesta

SGE - QSUB deja de enviar los trabajos en el modo -sync

Tengo un script en Perl que prepara los archivos de entrada a un programa binario y se somete la ejecución del programa binario de la cola SGE versión del sistema 6.2u2. Los trabajos se presentarán co

environment sync qsub sungridengine 2011-02-03

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