MySQL odbc timeout from R

Question

Estoy usando R para leer algunos datos de una base de datos MySQL usando el paquete RODBC. Los datos se procesan y algunos resultados se envían nuevamente a la base de datos. El problema es que el servidor cierra la conexión después de aproximadamente un minuto debido a la inactividad, que es el tiempo necesario para procesar los datos localmente. Es un servidor compartido, por lo que el host no aumentará el tiempo de espera.

creo que hay dos posibilidades de evitar esto 1) abrir una conexión antes de cada transacción de base de datos y cerrar inmediatamente después de 2) envía un pequeño comando 'ping' al servidor cada 30 segundos o más para dejar que el el servidor sabe que todavía estoy allí.

Puedo implementar el primero bastante fácil, pero parece bastante lento para abrir y cerrar constantemente las conexiones. ¿Alguien sabe un comando eficiente para el segundo? O una mejor manera en conjunto?

Answer 1

La primera solución es la que yo prefiero. Es realmente difícil hacer esto último con un único programa de subprocesos como R. Si R está ocupado ejecutando análisis, no hay forma de que maneje el ping. A menos que esté haciendo cientos de lecturas/escrituras, el método de abrir y cerrar la conexión no debe introducir una cantidad extrema de sobrecarga.