Boxplot con datos de longitud variable en matplotlib

Question

He recopilado algunos datos en un archivo de texto y quiero crear un diagrama de caja. Pero este archivo de datos contiene filas de longitud variable, por ejemplo.

1,2, 2,3, 3,0, 4,5
1,1, 2,2, 2,9

para la misma longitud que sólo podía hacer
PW = numpy.loadtxt ("./ learning.dat")
matplotlib.boxplot (PW.T);

¿Cómo manejo las líneas de datos de longitud variable?

Answer 1

Simplemente use una lista de matrices o listas. boxplot tomará cualquier tipo de secuencia (Bueno, cualquier cosa que tenga un __len__, de todos modos. No funcionará con generadores, etc.).

ej .:

import matplotlib.pyplot as plt 
x = [[1.2, 2.3, 3.0, 4.5], 
    [1.1, 2.2, 2.9]] 
plt.boxplot(x) 
plt.show() 

Si estás preguntando cómo leer en los datos, hay un montón de maneras de hacer lo que quiere. Como un simple ejemplo:

import matplotlib.pyplot as plt 
import numpy as np 

def arrays_from_file(filename): 
    """Builds a list of variable length arrays from a comma-delimited text file""" 
    output = [] 
    with open(filename, 'r') as infile: 
     for line in infile: 
      line = np.array(line.strip().split(','), dtype=np.float) 
      output.append(line) 
    return output 

plt.boxplot(arrays_from_file('test.txt')) 
plt.show() 

Answer 2

También se puede hacer un diagrama de caja en Plot.ly, mediante la API de Python o simplemente la interfaz gráfica de usuario. Hice this graph, que se puede hacer en el navegador o con el Python API así:

box1 = {'y': [1.2, 2.3, 3.0, 4.5], 
'type': 'box'} 
box2 = {'y': [1.1, 2.2, 2.9], 
'type': 'box'} 
response = py.plot([box1, box2]) 
url = response['url'] 
filename = response['filename'] 

La revelación completa: estoy en el equipo de argumentalmente.