¿Cómo puedo producir tramas como esta?

Question

Me he topado con este tipo de diagrama que realiza una agrupación jerárquica sobre un conjunto determinado de datos de series temporales. ¿Puede alguien decirme cómo dibujar tales tramas?

Estoy abierto a implementaciones en R o Javascript, especialmente usando d3.js.

Answer 1

Siempre se puede crear la trama con la mano: con los gráficos de base, que el parámetro fig le permite añadir parcelas dentro de otra trama.

# Sample data 
n <- 100 
k <- 6 
d <- matrix(rnorm(k*n),nc=k) 
d[,2] <- d[,1] # To help check the results 
colnames(d) <- LETTERS[1:k] 
x <- apply(d,2,cumsum) 
r <- hclust(dist(t(d))) 
# Plot 
op <- par(mar=c(0,0,0,0),oma=c(0,2,0,0)) 
plot(NA,ylim=c(.5,k+.5), xlim=c(0,4),axes=FALSE) 
# Dendrogram. See ?hclust for details. 
xc <- yc <- rep(NA,k) 
o <- 1:k 
o[r$order] <- 1:k 
for(i in 1:(k-1)) { 
    a <- r$merge[i,1] 
    x1 <- if(a<0) o[-a] else xc[a] 
    y1 <- if(a<0) 0 else yc[a] 
    b <- r$merge[i,2] 
    x2 <- if(b<0) o[-b] else xc[b] 
    y2 <- if(b<0) 0 else yc[b] 
    lines( 
    3+c(y1,i,i,y2)/k, 
    c(x1,x1,x2,x2), 
    lwd=k-i 
) 
    xc[i] <- (x1+x2)/2 
    yc[i] <- i 
} 
# Time series 
axis(2,1:k,colnames(d)[r$order],las=1) 
u <- par()$usr 
for(i in 1:k) { 
    f <- c(0,3,i-.5,i+.5) 
    f <- c( 
    (f[1]-u[1])/(u[2]-u[1]), 
    (f[2]-u[1])/(u[2]-u[1]), 
    (f[3]-u[3])/(u[4]-u[3]), 
    (f[4]-u[3])/(u[4]-u[3]) 
) 
    par(new=TRUE,fig=f) 
    plot(x[,r$order[i]],axes=FALSE,xlab="",ylab="",main="",type="l",col="navy",lwd=2) 
    box() 
} 
par(op) 

(Después de escribir esto, me doy cuenta de que es probable que sea más fácil de ver con layout ...)