¿Cómo importar CSV en sqlite usando RSqlite?

Question

Como pregunta, encontré que puedo usar .import en el shell sqlite, pero parece que no está funcionando en el entorno R, ¿alguna sugerencia?

Answer 1

Puede usar read.csv.sql en el paquete sqldf. Es solo una línea de código para hacer la lectura. Suponiendo que desea crear una nueva base de datos, testingdb, y luego leer un archivo en él intente esto:

# create a test file 
write.table(iris, "iris.csv", sep = ",", quote = FALSE, row.names = FALSE) 

# create an empty database. 
# can skip this step if database already exists. 
sqldf("attach testingdb as new") 
# or: cat(file = "testingdb") 

# read into table called iris in the testingdb sqlite database 
library(sqldf) 
read.csv.sql("iris.csv", sql = "create table main.iris as select * from file", 
    dbname = "testingdb") 

# look at first three lines 
sqldf("select * from main.iris limit 3", dbname = "testingdb") 

Lo anterior sqldf utiliza que utiliza RSQLite. También puede usar RSQLite directamente. Ver ?dbWriteTable en RSQLite. Tenga en cuenta que puede haber problemas con los finales de línea si lo hace directamente con dbWriteTable que sqldf manejará automáticamente (generalmente).

Si su intención era leer el archivo en R inmediatamente después de leerlos en la base de datos y que realmente no necesita la base de datos después de que a continuación, ver:

http://code.google.com/p/sqldf/#Example_13._read.csv.sql_and_read.csv2.sql

Answer 2

que tienden a hacer eso con el paquete sqldf: Quickly reading very large tables as dataframes in R

Tenga en cuenta que en el ejemplo anterior que leí el CSV en una base de datos SQLite temp. Obviamente tendrá que cambiar ese bit.