Mi enfoque habitual sería tratar un sitio con un único propósito. "Soltero" en realidad define un amplio objetivo y patrón de uso aquí. Si las múltiples aplicaciones de todos encajan juntos y trabajar hacia sinérgica única finalidad del sitio, entonces
mydomain.com/app1 y mydomain.com/app2 es bastante bien.
Significa que existen y viven para aumentar el sitio principal.
Si las aplicaciones no tienen nada mucho que ver con la otra y casi en vivo en su "propio mundo", entonces probablemente debería existir como sus subdominios.
app1.mydomain.com y app2.mydomain.com
esto le permite configurar su estrategia de DNS a diferentes direcciones IP (servidores web/granjas) en lugar de agrupamiento juntos en la misma piscina.