problema utilizando los métodos de escáner

Question

Tengo un archivo de registro que contiene los siguientes datos nextLine() y hasNextLine():

ruta más corta (2) :: RV3280-RV0973C-RV2888C
ruta más corta (1): : RV3280-RV2502C
ruta más corta (2) :: RV3280-RV2501C-RV1263
ruta más corta (2) :: RV2363-Rv3285-RV3280

de cada línea, requiero el número dentro de los corchetes, el nombre de la primera proteína (RV3280 en la primera línea) y el nombre de la última proteína (RV2888C en la primera línea).

He escrito un código para esto usando el objeto Scanner.

try{ 
       Scanner s = new Scanner(new File(args[0])); 
       while (s.hasNextLine()) { 
        s.findInLine("Shortest path\\((\\d+)\\)::(\\w+).*-(\\w+)"); // at each line, look for this pattern 
        MatchResult result = s.match(); // results from 
        for (int i=1; i<=result.groupCount(); i++) { 
         System.out.println(result.group(i)); 
        } 
        s.nextLine(); // line no. 29 
       } 
       s.close(); 
     } 

     catch (FileNotFoundException e) { 
      System.out.print("cannot find file"); 
     } 

Obtengo los resultados deseados pero también recibo un mensaje de error. La salida que recibo para el archivo de entrada anterior es:

Exception in thread "main" java.util.NoSuchElementException: No line found 
     at java.util.Scanner.nextLine(Scanner.java:1516) 
     at nearnessindex.Main.main(Main.java:29) 
2 
RV3280 
RV2888C 
1 
RV3280 
RV2502C 
2 
RV3280 
RV1263 
2 
RV2363 
RV3280 
Java Result: 1 
BUILD SUCCESSFUL (total time: 1 second) 

¿Por qué ocurre este error y cómo puedo corregirlo?

Answer 1

Sus datos de entrada probablemente no termina con un separador de línea que causaría esto. Las llamadas a findInLine mueve el escáner más allá de la coincidencia de patrones y si usted está en el final de los datos de entrada al llamar nextLine que se lanzan al NoSuchElementException

Una solución fácil y sin re-organización del código a mucho sería poner fin al mismo tiempo bucle con:

if (s.hasNextLine()) { 
    s.nextLine(); 
} 

Answer 2

public static void main(String[] args) { 
      Scanner s = new Scanner("Shortest path(2)::RV3280-RV0973C-RV2888C" 
        + "\nShortest path(1)::RV3280-RV2502C" 
        + "\nShortest path(2)::RV3280-RV2501C-RV1263" 
        + "\nShortest path(2)::RV2363-Rv3285-RV3280"); 
      while (s.hasNextLine()) { 
       s.findInLine("Shortest path\\((\\d+)\\)::(\\w+).*-(\\w+)"); // at each line, look for this pattern 
       MatchResult result = s.match(); // results from 
       for (int i = 1; i <= result.groupCount(); i++) { 
        System.out.println(result.group(i)); 
       } 
       s.nextLine(); // line no. 29 
      } 
      s.close(); 
    } 
} 

run: 
2 
RV3280 
RV2888C 
1 
RV3280 
RV2502C 
2 
RV3280 
RV1263 
2 
RV2363 
RV3280 
BUILD SUCCESSFUL (total time: 0 seconds) 

Esto funciona bien para mí, ¿quizás tiene algunos caracteres extraños o líneas vacías en su archivo?

2 líneas vacías al final me dan que: Excepción en hilo java.lang.IllegalStateException "principal": Ningún resultado fósforo disponible

Si el archivo de entrada es que estrictamente el formato, que puede hacer algo por el estilo , que es mucho más fácil porque usted puede deshacerse de ese desagradable expresión regular;)

String[] lines = new String[]{"Shortest path(2)::RV3280-RV0973C-RV2888C", "Shortest path(1)::RV3280-RV2502C", "Shortest path(2)::RV3280-RV2501C-RV1263", "Shortest path(2)::RV2363-Rv3285-RV3280", "\n", "\n"}; 
    final int positionOfIndex = 14; 
    final int startPositionOfProteins = 18; 
    for (String line : lines) { 
     if (!line.trim().isEmpty()) { 
      System.out.print(line.charAt(positionOfIndex) + ": "); 
      String[] proteins = line.substring(startPositionOfProteins).split("-"); 
      System.out.println(proteins[0] + " " + proteins[proteins.size() -1]); 

     } 
    }