Tengo un código C para cómputo paralelo escrito para gcc, y quiero compilarlo en un clúster, que aparentemente usa icc a través de mpicc. Corregir el código para que sea icc -friendly parece exigir demasiado tiempo, por lo que me pregunto si puedo pedir OpenMPI para usar gcc en su lugar. No tengo los derechos de administrador en ese clúster, y preferiría no ensuciar la configuración original.Cómo forzar a OpenMPI a usar GCC en lugar de ICC? ¿Es necesario recompilar OpenMPI?
Si no es posible configurar, p. Makefile, entonces podría compilar OpenMPI en mi directorio de inicio, pero necesito alguna orientación sobre lo que debe hacerse después de eso. ¿Usted me podría ayudar?
Update1
El Makefile contiene
CC = mpicc
CFLAGS += -DMPI
Y aquí están algunos archivos openmpi
$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
lrwxr-xr-x /usr/bin/mpicc -> opal_wrapper
-rwxr-xr-x /usr/bin/opal_wrapper
que me haga saber, si puedo proporcionar más información.
Update2
Con la help of Jeff, yo era capaz de encontrar OpenMPI ajustes para mpicc
$ more /usr/local/share/openmpi/mpicc-wrapper-data.txt
project=Open MPI
project_short=OMPI
version=1.1.4
language=C
compiler_env=CC
compiler_flags_env=CFLAGS
compiler=icc
extra_includes= openmpi
preprocessor_flags=
compiler_flags=-pthread
linker_flags=
libs=-lmpi -lorte -lopal -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -lutil -ldl
required_file=
Sin embargo, no tengo los derechos para editar este archivo, y OPMI_CC = gcc doesn' t cambiar el compilador.
Update3
variable ambiental CC = gcc no ayuda
$ export CC=gcc
$ echo $CC
gcc
$ make clean $$ make
...icc:...errors
Update4
... pero export OMPI_CC=gcc hace aleta ally help (thanks to sharth). Debería Recuerdo un día que son cosas diferentes ...
A pesar de que el binario fue creado, que tiene el siguiente mensaje de adiós
/opt/intel/fce/9.1.036/lib/libimf.so: warning: warning: feupdateenv is not implemented and will always fail
'Makefile' tiene' CC = mpicc' y 'CFLAGS + = -DMPI'. De lo contrario, no obtengo la interfaz 'mpi'. ¿Es correcto? – Andrei
@Andrei: Esas no son variables ambientales.Usted los quiere, además de establecer las variables ambientales que sugerí arriba. –
Bien, veo mi error. Acabo de intentar como sugieres, y sigue siendo 'icc'. ¿Puede ser que pueda echarle un vistazo a la página sugerida por Jeff? ¿Hago lo que dice? – Andrei