total marginal en las tablas

Question

Tengo un marco de datos con una serie de infecciones identificadas a partir de aislados clínicos en diferentes fechas.

Hasta ahora he organizado los datos en una forma con la que quiero empezar a trabajar. Estoy tratando de preparar una serie de tablas de tablas para las estadísticas descriptivas del informe.

He estado usando ftable y obtener los siguientes:

onset.types <- ftable(SAB$Onset,SAB$MRSA.Type,year(SAB$Collection.Date)) 
          2005 2006 2007 2008 2009 2010 

Community      454 472 512 499 525 512 
      AUS-2/3-like   28 23 27 29 32 38 
      EMRSA-15-like   9 4 4 9 8 8 
      nmMRSA    40 47 53 39 64 60 
      Other mMRSA   1 3 3 11 5 9 
      unclassified MRSA  0 2 0 0 1 1 
Hospital      163 163 156 164 149 165 
      AUS-2/3-like   31 33 27 31 29 28 
      EMRSA-15-like   3 8 5 9 4 3 
      nmMRSA    10 9 13 17 13 12 
      Other mMRSA   5 1 6 2 3 10 
      unclassified MRSA  2 0 1 0 0 0 

Dos preguntas:

1: ¿Cómo puedo calcular los totales marginales

2: ¿Hay una manera fácil de calcular porcentajes así como cuenta de nuevo con totales marginales

He intentado epitools y no me pareció tan útil como me hubiera gustado.

Muchas gracias.

Answer 1

Para añadir márgenes, utilice la addmargins()

addmargins(table(state.division, state.region)) 
        state.region 
state.division  Northeast South North Central West Sum 
    New England    6  0    0 0 6 
    Middle Atlantic   3  0    0 0 3 
    South Atlantic    0  8    0 0 8 
    East South Central   0  4    0 0 4 
    West South Central   0  4    0 0 4 
    East North Central   0  0    5 0 5 
    West North Central   0  0    7 0 7 
    Mountain     0  0    0 8 8 
    Pacific     0  0    0 5 5 
    Sum      9 16   12 13 50 

Para el cálculo de porcentajes, utilice prop.table()

prop.table(table(state.division, state.region)) 
        state.region 
state.division  Northeast South North Central West 
    New England    0.12 0.00   0.00 0.00 
    Middle Atlantic   0.06 0.00   0.00 0.00 
    South Atlantic   0.00 0.16   0.00 0.00 
    East South Central  0.00 0.08   0.00 0.00 
    West South Central  0.00 0.08   0.00 0.00 
    East North Central  0.00 0.00   0.10 0.00 
    West North Central  0.00 0.00   0.14 0.00 
    Mountain    0.00 0.00   0.00 0.16 
    Pacific     0.00 0.00   0.00 0.10