R: heatmap.2 cambiar la clave de color

Question

Tengo una pregunta sobre el paquete gplots. Quiero utilizar la función heatmap.2 y por lo tanto quiero cambiar mi punto simétrico de clave de color de 0 a 1. Normalmente, cuando symkey=TRUE y se utiliza el col=redgreen(), se crea una barra de colores donde los colores se gestionan de esta manera:

red = -2 to -0.5 
black=-0.5 to 0.5 
green= 0.5 to 2 

Ahora quiero crear una barra de colores de esta manera:

red= -1 to 0.8 
black= 0.8 to 1.2 
green= 1.2 to 3 

es algo como esto posible?

¡Gracias!

Answer 1

Si mira the heatmap.2 help file, parece que desea el argumento breaks. Desde el archivo de ayuda:

breaks (opcional) O bien un vector numérico que indica los puntos de división para binning x en colores, o un número entero de puntos de ruptura que se utilizará, en cuyo caso los puntos de ruptura se espaciados igualmente entre mínimo (x) y máximo (x)

Por lo tanto, utilice breaks para especificar los puntos de corte para cada color. ej .:

library(gplots) 

# make up a bunch of random data from -1, -.9, -.8, ..., 2.9, 3 
# 10x10 
x = matrix(sample(seq(-1,3,by=.1),100,replace=TRUE),ncol=10) 

# plot. We want -1 to 0.8 being red, 0.8 to 1.2 being black, 1.2 to 3 being green. 
heatmap.2(x, col=redgreen, breaks=c(-1,0.8,1.2,3)) 

El bit crucial es la breaks=c(-1,0.8,1.2,3) siendo sus puntos de corte.