Al parecer, IBM comenzó a enviar un servidor de aplicaciones real comenzando con RAD/RSA6 en lugar del servidor de prueba que viene con WSAD. Entonces, para configurar el servidor de aplicaciones solo es necesario usar la interfaz de administrador web como de costumbre.
Gracias a Jeanne Boyarsky por la respuesta en los foros de The Java Ranch.
La aplicación anterior que estoy portando necesita algunas propiedades en las propiedades del sistema de JVM para que puedan ser recuperadas con System.getProperty (...) y encontré una manera sucia de hacerlo funcionar. Entonces, hasta que descubra cómo hacerlo de la manera adecuada, si hay una forma adecuada, se me ocurrió este truco:
Después de hacer "encontrar" y "grep" en el directorio de perfil del servidor de aplicaciones i encontró un archivo llamado: runtimes\base_v7\profiles\<profilename>\config\cells\<cellname>\nodes\<nodename>\servers\<servername>\server.xml
En la parte inferior de server.xml hay una etiqueta <jvmEntries xmi:id="JavaVirtualMachine_.....
En su interior se puede agregar etiquetas de las propiedades del sistema en el formato: <systemProperties xmi:id="someId" name="name of your property" value="the value" required="false"/>
Cualquier persona que sabe que esto de la manera correcta y ha leído todo el camino hasta aquí debe estar llorando por ahora ... :) embargo, que las costuras a trabajar ...