En primer lugar, bienvenido a Prolog! Creo que lo encontrarás gratificante y agradable.
Los libros que veo habitualmente recomendados son El arte de Prolog, programación Prolog y Cláusula y Efecto. Tengo Arte y Programación y ambos son buenos libros; Arte es ciertamente más enciclopédico y Programación es más lineal. Yo consulto Art y Craft mucho últimamente, y algunos más raros (Logic Grammars por ejemplo). Espero comprar Prolog Programming en profundidad siguiente. No creo que haya muchos libros malos de Prolog que uno deba tratar de evitar. Probablemente salvaría Craft y Practique para más adelante.
Puede cargar varios archivos a la vez, mediante su inclusión:
:- [file1, file2, file3].
Además, dado que 'name.pl' termina en '.pl' se puede omitir las comillas; las comillas simples solo son realmente necesarias si Prolog no toma el encerrado como un átomo ordinariamente.
Espero que esto ayude y buena suerte en su viaje. :)
También me gustaría mencionar el libro de Ivan Bratko, "Programación Prolog para inteligencia artificial", elogiado (merecidamente) por su estilo de presentación claro y lúcido. –