Suprimir mensajes de advertencia C en R

Question

Llamo a una función R desde el paquete R e1071 que está interconectado con libsvm (un programa C). Esta función pasa mensajes de advertencia C (printf) a la consola R. Lo sé porque los mensajes de advertencia son de la forma (advertencia: ...) mientras que los mensajes de advertencia R están en mayúscula (es decir, Advertencia: ...).

He intentado todo para deshacerme de estos mensajes en R (sink, suppressWarnings, invisible) pero nada parece funcionar.

¿Alguna idea?

Gracias!

Answer 1

La función utiliza stdio en lugar de Rprintf/REprintf o warning por lo que re-dirección de la salida R no funcionará. La solución adecuada es arreglar las llamadas en libsvm para usar la salida R en su lugar.

Hackear el stdio de salida es posible - se puede volver a dirigir la salida a su propia tubería y hacer lo que quiera con él, pero a) es un poco de trabajo en C y B) que es peligroso porque es necesario para restaurar el comportamiento estándar una vez que haya terminado con la función, incluso si se produce un error yc) puede interactuar con la salida R si se usa en un shell.

Si desea una solución rápida sin embargo, muy loco, sucio, ejecutar su función en collect(parallel(..., silent=TRUE))[[1]] de multicore - se suprime la salida estándar (se puede añadir multicore:::closeStderr() si desea suprimir stderr también).