Doxygen es un poco lento: lleva aproximadamente un par de minutos procesar todo el proyecto, por lo que para pequeños cambios incrementales es más largo que construir el resto de mi código. Hay miles de archivos sin documentación, así que supongo que está pasando la mayor parte del tiempo procesándolos. ¿Hay alguna forma de evitar que se salte archivos sin documentación?¿Cómo hacer que doxygen funcione más rápido?
¿Qué tal si solo procesa archivos modificados?
Esta es probablemente la mejor idea que se me ocurre, puedo excluir los directorios que aún no incluyen documentación. –